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あらすじ

A.C.195年、地球圏統一連合の支配に反目する一部のコロニー居住者による地下組織が「オペレーション・メテオ」を発動させる。

それは流星に偽装した5機のモビルスーツ(MS）「ガンダム」をパイロットと共に地球に降下させ、破壊活動に行わせるというものである。

しかしこの作戦は事前に「M作戦」の名で連合及びOZに察知されていた。

このため工作員の一人ヒイロ・ユイの乗機は地球への降下中に、OZの攻撃輸送機との遭遇戦で海に落下

その後リリーナ・ドーリアンと出会うこととなる。

そして互いを知らぬまま地球に降下した他の工作員たち

デュオ・マックスウェル、トロワ・バートン、カトル・ラバーバ・ウィナー、張五飛も、ガンダムパイロット同士や様々な人間と出会い、時代を動かしていくこととなる。​